ベビーとゴンちゃんは冒険に出かけますが、ある朝トップスが行方不明に。彼らはトップスを探す中で、「ほねほねサムライ」のホネ太郎と出会います。ホネ太郎の正体とトップスの行方が物語の鍵となります。